MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 109476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019965	CCCG	2	8	43178	43185	0 %	0 %	25 %	75 %	433640169
1003	NC_019965	CGGG	2	8	43207	43214	0 %	0 %	75 %	25 %	433640169
1004	NC_019965	GGC	2	6	43248	43253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640169
1005	NC_019965	GCA	2	6	43258	43263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640169
1006	NC_019965	CGG	2	6	43285	43290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640169
1007	NC_019965	CAC	2	6	43298	43303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640169
1008	NC_019965	GCC	2	6	43325	43330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640169
1009	NC_019965	GC	3	6	43349	43354	0 %	0 %	50 %	50 %	433640169
1010	NC_019965	CGT	2	6	43404	43409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019965	GTG	2	6	43481	43486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019965	GGC	2	6	43590	43595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640170
1013	NC_019965	CGA	2	6	43607	43612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640170
1014	NC_019965	CCG	2	6	43645	43650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640170
1015	NC_019965	GAC	2	6	43764	43769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640170
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1017	NC_019965	TGG	2	6	43876	43881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640170
1018	NC_019965	TGC	2	6	43891	43896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640170
1019	NC_019965	CCG	2	6	43927	43932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640170
1020	NC_019965	CGT	2	6	43985	43990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640170
1021	NC_019965	CGC	2	6	43998	44003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640170
1022	NC_019965	CGA	2	6	44037	44042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640170
1023	NC_019965	ACC	2	6	44052	44057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640170
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1025	NC_019965	GC	3	6	44136	44141	0 %	0 %	50 %	50 %	433640170
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1028	NC_019965	CGA	2	6	44243	44248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640170
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1030	NC_019965	GAT	2	6	44390	44395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640170
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1032	NC_019965	CGA	2	6	44426	44431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640170
1033	NC_019965	TGA	2	6	44534	44539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640170
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1035	NC_019965	CAC	2	6	44622	44627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640170
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1040	NC_019965	CGC	2	6	44735	44740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640170
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1042	NC_019965	GGTAC	2	10	44863	44872	20 %	20 %	40 %	20 %	433640170
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1052	NC_019965	CGGC	2	8	45480	45487	0 %	0 %	50 %	50 %	433640170
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1056	NC_019965	GCTTAC	2	12	45657	45668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433640170
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1093	NC_019965	TCATG	2	10	47205	47214	20 %	40 %	20 %	20 %	433640171
1094	NC_019965	CTAC	2	8	47220	47227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1096	NC_019965	ATCGG	2	10	47352	47361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_019965	GAG	2	6	47380	47385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640172
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1101	NC_019965	GCG	2	6	47560	47565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640172
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1109	NC_019965	CGC	2	6	48359	48364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640173
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1111	NC_019965	GTGC	2	8	48420	48427	0 %	25 %	50 %	25 %	433640173
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1120	NC_019965	GCCG	2	8	48704	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	433640173
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1125	NC_019965	TGC	2	6	48967	48972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640173
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1247	NC_019965	CG	3	6	53921	53926	0 %	0 %	50 %	50 %	433640179
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1252	NC_019965	CGA	2	6	54067	54072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640179
1253	NC_019965	TGC	2	6	54103	54108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640179
1254	NC_019965	CAT	2	6	54122	54127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640179
1255	NC_019965	CGG	2	6	54157	54162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640179
1256	NC_019965	AGC	2	6	54193	54198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640179
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1258	NC_019965	CGG	2	6	54237	54242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640179
1259	NC_019965	CGG	2	6	54259	54264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640179
1260	NC_019965	TGG	2	6	54313	54318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640179
1261	NC_019965	CT	3	6	54328	54333	0 %	50 %	0 %	50 %	433640179
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1263	NC_019965	GCC	2	6	54374	54379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640179
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1265	NC_019965	TGG	2	6	54499	54504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640179
1266	NC_019965	CAC	3	9	54506	54514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640179
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1269	NC_019965	GTGC	2	8	54627	54634	0 %	25 %	50 %	25 %	433640179
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1273	NC_019965	CGAGGG	2	12	54806	54817	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	433640179
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1275	NC_019965	GCTCAA	2	12	54884	54895	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433640179
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1288	NC_019965	GGTG	2	8	55514	55521	0 %	25 %	75 %	0 %	433640179
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1313	NC_019965	GCG	2	6	56470	56475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640180
1314	NC_019965	TGT	2	6	56535	56540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640180
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1342	NC_019965	TGC	2	6	57406	57411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1362	NC_019965	GGT	2	6	58070	58075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1364	NC_019965	AGG	2	6	58180	58185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1365	NC_019965	TGA	2	6	58186	58191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1366	NC_019965	GACCC	2	10	58229	58238	20 %	0 %	20 %	60 %	433640182
1367	NC_019965	CGA	2	6	58240	58245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640182
1368	NC_019965	CGT	2	6	58282	58287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640182
1369	NC_019965	CGG	2	6	58297	58302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640182
1370	NC_019965	GTG	2	6	58379	58384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640182
1371	NC_019965	GCC	2	6	58397	58402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640182
1372	NC_019965	GAA	3	9	58543	58551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1373	NC_019965	GCC	2	6	58560	58565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1374	NC_019965	AGG	2	6	58582	58587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_019965	ACC	2	6	58605	58610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640183
1376	NC_019965	TCG	2	6	58618	58623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640183
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1490	NC_019965	GC	3	6	63115	63120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1491	NC_019965	CGAG	2	8	63121	63128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1492	NC_019965	GGTC	2	8	63129	63136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1493	NC_019965	CGA	2	6	63143	63148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1494	NC_019965	CAG	2	6	63180	63185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1495	NC_019965	GCGG	2	8	63209	63216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1496	NC_019965	ACC	2	6	63250	63255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1497	NC_019965	CGG	2	6	63256	63261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_019965	TCC	2	6	63286	63291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_019965	GCA	2	6	63515	63520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_019965	AACTTC	2	12	63533	63544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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